一、應(yīng)用原理:
(1)通過(guò)DNA測(cè)序?qū)ξ⑸镞M(jìn)行物種鑒定(菌種鑒定)是比傳統(tǒng)生化鑒定更先進(jìn)的鑒定方法。DNA測(cè)序不依賴菌種本身特點(diǎn),對(duì)所有菌種均可使用。比傳統(tǒng)生化鑒定更加快速,準(zhǔn)確。微生物物種鑒定包括細(xì)菌16srDNA鑒定和真菌26S/28SrDNA鑒定、真菌ITS鑒定。
(2)通過(guò)大量實(shí)驗(yàn)優(yōu)化的通用引物適用于99%以上的微生物,鑒定成功率在95%以上。常規(guī)鑒定內(nèi)容有形態(tài)特征和理化特性。形態(tài)特征包括顯微形態(tài)和培養(yǎng)特征;理化特性包括營(yíng)養(yǎng)類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應(yīng)、酶反應(yīng)和血清學(xué)反應(yīng)等。
(3)BIOLOG鑒定系統(tǒng)以微生物對(duì)不同碳源的利用情況為基礎(chǔ),檢測(cè)微生物的特征指紋圖譜,建立與微生物種類相對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)。通過(guò)軟件將待測(cè)微生物與數(shù)據(jù)庫(kù)參比,得出鑒定結(jié)果。該系統(tǒng)已獲美國(guó)FDA認(rèn)可,已逐步應(yīng)用于食品和飲品企業(yè)、環(huán)保、海洋生物/水產(chǎn)品、制藥、農(nóng)業(yè)微生物、生物治理、化妝品、臨床等領(lǐng)域的微生物鑒定試驗(yàn)中。
二、鑒定領(lǐng)域:API鑒定系統(tǒng)涵蓋15個(gè)鑒定系列,約有1000種生化反應(yīng),已可鑒定超過(guò)600種的細(xì)菌。鑒定過(guò)程中,可根據(jù)細(xì)菌所屬類群選擇適當(dāng)?shù)纳砩b定系列,通過(guò)軟件將待測(cè)細(xì)菌與數(shù)據(jù)庫(kù)參比,得出鑒定結(jié)果。可應(yīng)用API50CH系列、API20E系列、APIStaph系列對(duì)乳酸桿菌(Lactobacillussp.)和相關(guān)細(xì)菌、芽孢桿菌(Bacillussp.)、葡萄球菌屬(Staphylococcussp.)、微球菌屬(Micrococcussp.)和庫(kù)克菌屬(Locuriasp.)進(jìn)行鑒定。